本发明公开了一种上下堆叠多颗芯片时减少芯片间互连线的方法，包括：在上下堆叠多颗芯片中的每个芯片上设置双向控制单元；每个芯片的微控制器标准系统总线中输入数据总线信号和输出数据总线信号连接至双向控制单元；每个芯片的微控制器标准系统总线中数据总线读写使能信号连接至每个双向控制单元；通过互连线将双向控制单元分别上下连接。本发明采用了双向控制单元整合微控制器标准系统总线中输入数据总线和输出数据总线的信号线，减少用微控制器标准系统总线做管脚互连的上下堆叠芯片间互连线的数量，降低互连封装后的片上系统芯片成本。