本发明适用于医疗器械领域，提供了一种穴位皮肤组织内微循环的实时监测方法、系统及探测头。方法包括以下步骤：计算机控制激光器按照一定频率输出激光；所述激光通过光纤传导到探测头以供照射待测组织；探测头中的超声换能器接收组织内产生的超声信号，并将所述组织内产生的超声信号传回给计算机；计算机根据所述组织内产生的超声信号生成图像。本发明实施例利用光声成像技术实时获得穴位皮肤组织内微循环信息，解决穴位皮肤组织内微循环的实时监测问题，为相关疾病的早期诊断或治疗提供依据或及指导意见。本发明在针灸过程中对穴位皮肤组织进行光声成像，整个过程不需要移动探测头或者生物组织，达到实时监测穴位皮肤组织内微循环。