本发明的畜禽发酵饲料用复合菌制剂的制备方法、及其应用，选用的乳酸菌同型乳酸发酵的厌氧菌，主要包括屎肠球菌、粪肠球菌和嗜热链球菌，是畜禽养殖业最常用的乳酸菌，代谢过程基本不产生气体，只要保持发酵体系有较好的密闭性，对绝大多数畜禽饲料的发酵都有较好的适用性。选用的酵母菌是面包酵母菌，就是商业市场上流通的生产面包的酵母菌，每克面包酵母干粉含100亿cfu活性酵母菌；制备出的复合菌制剂含水量一般不超过9.0%，在真空包装条件下可存放3-6个月，酵母菌的数量基本不变，活性乳酸菌的数量保存在50-65%左右。这种复合菌产品在畜禽发酵饲料中接种0.1～0.2%就可以很好地启动发酵。