本发明涉及一种稳定控制的超连续谱光子晶体光纤激光器，包括依次设置的能预先补偿进入光纤中激光偏振变化的偏振控制模块，将激光进行放大的光纤放大模块，将超连续谱进行展宽的超连续谱展宽模块，和进行光强探测的偏振探测模块，以及对输出光强进行实时监控的分析控制模块；所述偏振控制模块、光纤放大模块、超连续谱展宽模块、偏振探测模块和分析控制模块依次连接，分析控制模块的输出信号再反馈到偏振控制模块上。本发明利用超连续谱展宽自身产生的偏振相关特性以及压电陶瓷挤压光纤，具有反应快、成本低廉、结构简单、稳定性高等优点，有利于在光谱探测、光梳合成等领域大规模推广应用。