本发明公开了一种基于微机电系统MEMS的多通道可调谐光纤激光器及其控制方法。本发明在结构中摒弃了常见的多通道光纤激光器内部由多个独立激光器简单组合的笨拙方案，巧妙地采用多个光纤光学模块共享同一个体光学模块，实现仅利用一块MEMS处理器同时独立调谐多路激光输出的目的，并有利于本发明向集成化、小型化、高精度、多功能方向发展。本发明可同时输出多个波长通道的激光，每个通道的激光波长均可在光纤放大器发出的波段内连续可调，各通道之间独立开关控制；各通道的输出波长和输出功率均可同时独立进行本地或远程软件调谐。整个实验对环境的要求不高，操作简单，易于产品化。