本发明涉及一种光纤激光器及光纤激光器打标系统，其中光纤激光器包括用于产生激光信号的激光器主体、用于输出激光信号并隔离反射回来的激光信号的激光输出头，激光器主体与激光输出头直接连接，激光器主体与激光输出头之间的连接光纤设置于激光器主体内部。本发明通过将激光器主体与激光输出头直接连接，且将激光器主体与激光输出头之间的连接光纤设置于激光器主体内部，省去了光纤连接尾纤，使得光纤激光器结构紧凑、体积小、成本低，且不易损坏，不仅便于装配和运输，也更加便于集成。