本发明属于水环境保护技术领域，尤其涉及一种减少生物活性炭微型动物泄漏的方法与装置，其特征在于，包含：步骤201：在生物活性炭反应器内的颗粒活性炭层上部设置一薄层活性炭纤维层；步骤202：以自上往下向流的方式通过颗粒活性炭反应器过滤原水，依次通过活性炭纤维层、颗粒活性炭层和石英砂层；步骤203：以自下往上向流方式通过颗粒活性炭反应器对滤芯作反冲洗，依次通过石英砂层、颗粒活性炭层和活性炭纤维层。本发明相比其他方法，可以在反冲洗时截留颗粒活性炭，并提高活性炭净水效果。