本发明涉及基因工程领域，具体地，本发明涉及一种耐热中性纤维素酶Cel61及其基因。本发明提供了一种来源于Humicola insolens X9的纤维素酶Cel61，其氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示，且本发明提供了编码上述中性纤维素酶的编码基因cel61。本发明的纤维素酶具有以下性质：最适pH7.0，最适温度65℃，良好的热稳定性，在中性和碱性范围内依然保持较高酶活，与纤维二糖水解酶协同作用，在复合纤维素酶中添加可以有效提微晶纤维素的水解效率。做为一种新型的纤维素酶制剂，可广泛用于能源、纺织等工业。