本发明公开了一种脱除水溶液中微量锰的方法。该方法通过对在锰环境生长植物的培养和剖析，用酸或碱调节含锰水溶液的pH值，同时或分别加入含钙试剂、磷酸盐和碳酸盐，经过静置，沉淀后，分离出含锰渣的水经检测其所含锰的含量小于0.01mg/L。该方法的特点是通过控制含钙试剂、磷酸盐和碳酸盐的加入量，以及溶液的pH值，可脱除含水溶液中的微量含锰化物，且水处理时间短，所用原料经济易得，未向体系中添加任何有害元素，因此是一种环境友好型且经济的处理工艺。该工艺可以广泛应用于金属加工业、电镀业、机械制造业、催化业、制革业和纺织业等领域所排放的含锰废水的处理。