本发明公开了一种罗氏沼虾工厂化育苗水质超滤净化方法。本发明的方法包括初级沉淀、人工海水配制和暗沉淀、物理过滤、膜分离和臭氧灭菌五个步骤。本发明能去除养殖水源中直径0.1微米以上的所有悬浮颗粒及单胞藻类，水体透明度达2米以上，氨氮去除率达90％以上，处理后水质适合于名贵鱼虾苗种繁育使用；经超滤膜分离加上二次臭氧灭菌可以去除99％以的微生物(一般微生物直径在0.3微米以上)，有效截断了外界环境中有害微生物的横向传播途径，保障鱼虾育苗的稳定生产。