本发明涉及一种生态防治鱼类疾病的方法，尤其涉及一种生态防治鱼类尤其是杂交鳢或笋壳鱼（云斑塘鳢）的流行性溃疡综合症的方法。该方法为将发病鱼类养殖在有生物絮团的水体中。通过多次实验证实，本发明的方法能有效地防治鱼类流行性溃疡综合症，有效率达到70%。本发明成本低廉且环保，不需要使用药物、化学试剂及其他额外的试剂，有效率高，方法简单容易操作，并且使用该方法防治的鱼类不会由于防治该病的同时摄入其他有副作用的药物，有效保证人类食用的安全。