本发明涉及有机合成领域，特别涉及一种含短氟碳链涂层整理剂及其制备方法和应用。本发明的含短氟碳链涂层整理剂，其结构通式如式（Ⅰ）所示，制备方法包括：（1）双炔单体的制备；（2）叠氮单体的制备；（3）双炔和叠氮功能单体的“点击化学”合成短氟碳链涂层整理剂。该涂层整理剂可用于纺织品、纸张、建筑、金属、塑料、橡胶、陶瓷灯表面处理。本发明不仅能赋予材料优异的拒水拒油功能，而且由于其氟碳链氟原子为6，降解后不含PFOA和PFOS，不存在生物积累，是一种功能型绿色环保拒水拒油整理剂。