本发明适用于纺织领域，提供了一种异色涤棉混色纱的制作方法，将单色纤维、阳离子改性棉花、漂白棉和白涤纶先混纺成纱，再进行染色，所述阳离子改性棉花是将棉花或棉条经漂白处理后再进行阳离子改性处理。本发明通过将单色纤维、阳离子改性棉花、漂白棉和白涤纶的涤棉混纺成纱，再一次性染出两种或三种色调的涤棉混色纱，也可染出对比度较大的中浅色混色效果，而且操作简便，生产流程短，能耗低。