一种防治草鱼虫菌并发综合症的中草药复方制剂，由以下重量份的原料制成：辣蓼35-60份、烟叶5-60份、大黄5-15份、艾蒿0-20份。本发明的防治草鱼虫菌并发综合症的中草药复方制剂，治疗或预防草鱼虫菌并发综合症具有显著效果，可以减少病鱼死亡率和养殖风险。此外，该药物价廉易得，使用方法简便，药效快，安全性高，易于被基层渔民接受，大面积推广可以显著减少因该病造成的经济损失，其制备方法简单，适合规模化工业生产的需要。