本发明公开了一种左右壳均为橙色的长牡蛎新品系的选育方法，包括从养殖群体中挑选左壳色为紫色且外套膜色为黑色的个体作为雄性繁殖亲贝，挑选左壳色为黑色并且外套膜色为黑色的个体作为雌性繁殖亲贝，进行单配授精建立F1代家系；从F1代中挑选左右壳色均为紫黑色并且外套膜色为黑色的雌、雄个体作为繁殖亲贝，建立F2代家系；从F2代中继续挑选左右壳色均为紫黑色并且外套膜色为黑色的雌、雄个体作为繁殖亲贝，建立F3代家系；在F3代中选取橙色个体作为新品系的亲本，进行苗种扩繁，从而培育出性状稳定的左右壳均为橙色长牡蛎新品系，提高了产品的附加值，市场前景广阔。