一种抗禽流感的功能性饲料添加剂的制备方法，将人工合成H5N1亚型禽流感病毒血凝素基因的部分片段和真核表达载体pBI-221连接获得重组质粒，通过基因枪、电转化等转化方法将获得的重组质粒转化入杜氏藻细胞，使血凝素在杜氏藻细胞中表达，制备得到表达病毒蛋白亚单位的工程藻；将制备的工程藻细胞进行开放式扩大培养后，收集藻体，然后经低温干燥、制粒等加工工艺过程，得到一种抗禽流感的功能性饲料添加剂。本发明所制备的饲料添加剂应用于禽类养殖业具有抗禽流感的免疫保护作用，能够提高禽类机体的免疫力和生长速度，并且无任何毒副作用，生物安全性好。