一种实现不同波长输出的光纤激光器，其包括：一端面镀膜的传输光纤，其一端镀有反射膜，另外一端端面镀膜且封装了FC接头；一法兰盘，其一端与端面镀膜的传输光纤的FC接头连接；一增益光纤，其一端封装了FC接头，该增益光纤的FC接头与法兰盘的另一端连接；一光纤光栅，其输入端与增益光纤的另外一端连接；一波分复用器，其C端与光纤光栅的输出端连接，该波分复用器的R端为输出端；一半导体激光器，其输出端与波分复用器的P端连接。本发明在一个激光器的基础上，只需通过法兰盘20加接一次FC接头即可实现1030nm和1064nm两个波长的变换。