本发明公开了一种激光器光源波长校准的方法和系统，所述方法包括：接收激光器发出的包含有入射光强信息的入射激光信号，经封装于气体室内的预设浓度的标准气体吸收所述入射激光信号的能量后，得到能量变化后的透射激光信号，将所述透射激光信号转化成包含有出射光强信息的第一电信号，第一处理器依据所述出射光强信息，获取所述标准气体对应的吸收峰位置，确定与所述吸收峰位置对应的中心波长，以所述中心波长为基准，校准所述激光器的波长，解决了由于温度、老化以及半导体激光制作工艺造成的漂移问题，所述方法应用于系统中，实现了对激光器光源波长的校准，从而得到准确的激光器光源波长。