本发明提供一种医用内窥镜冷光源系统，其具有电源输入接口，包括LED光源模块及冷光源控制板；LED光源模块包括LED发光芯片、实时测量LED发光芯片的结温的结温测量传感器及对LED发光芯片进行制冷的半导体制冷片；冷光源控制板和LED光源模块电性连接，驱动LED光源模块工作，获取结温测量传感器测量的LED发光芯片的实时结温，并对比预设工作温度，当实时结温偏离预设工作温度时，控制半导体制冷片工作。医用内窥镜冷光源系统可根据LED发光芯片的寿命特性对其进行实时温控，并利用半导体制冷片进行散热，不因环境温度的不同而影响散热效果，可使LED发光芯片始终工作在最优状态。另外提供温控系统及医用内窥镜。