本发明公开了一种具有透明电极的倒装发光二极管的制造方法，包括：提供生长衬底，在其上顺序形成n型半导体层（6）、有源层（5）、p型半导体层（4）以及p型反射电极（2）；形成台阶结构；将透明绝缘材料填充进台阶结构，从而形成透明绝缘层（3）；在n型半导体层（6）上形成透明电极层（7）；形成通槽（8）并在通槽（8）中填充用于透明电极层（7）的透明导电材料；对倒装发光二极管进行切割，在整个倒装发光二极管的四个侧面以及顶面上都形成透明电极层（7）。本发明提出的方法制得的具有透明电极的发光二极管能提高集成度、简化工艺，无需引线结构，从而降低制造成本，且可提高光取出效率，从而提升整体发光效率。