本发明属于饲料添加剂领域，涉及一种预防草鱼脂肪肝的微生态制剂及其制备方法。所述微生态制剂为冷却干燥后的发酵的中草药提取液，所述中草药提取液以中草药海藻、荷叶、决明子、莱菔子为原料，所述发酵菌种为双歧杆菌、乳杆菌，所述发酵的中草药提取液的发酵酸度为1.5~2.0%，菌数为10^８cfu/ml以上。该微生态制剂的制备方法，包括如下步骤：（1）制备中草药提取液；（2）发酵中草药提取液：在灭菌后的中草药提取液中添加2~3%的双歧杆菌、乳杆菌进行发酵，发酵后的中草药提取液经冷却、干燥后即可。本发明提供了一种有效的饲料添加剂，可在养殖过程中预防草鱼脂肪肝，减少养殖户的经济损失，绿色环保，促进行业健康可持续发展。