本发明公开了一种提高香港牡蛎天然采苗效率的预报方法。本发明通过幼虫样品采集、表型分类、分子识别、综合评估和适时采苗等环节，在天然海区能够成功获取大量香港牡蛎稚贝。不但提高了天然采苗数量，保证了苗种质量，而且解决了以往盲目性采苗存在的数量不稳、种类混杂、多次复采等问题，这为香港牡蛎资源恢复及其养殖产业发展提供了充足的苗种来源。