本发明公开一种双液压缸同步控制系统，包括控制两个液压缸伸缩动作的方向控制阀，以及两个分别固定设置在两个所述液压缸上的背压阀；两个所述背压阀中，其中一者的先导开启压力大于另一者的先导开启压力，并配置成：伸出过程中，两个所述液压缸的进油支路和回油支路均并联；回缩过程中，两个所述液压缸的进油支路并联、回油支路串联，所述串联由小先导开启压力的所述背压阀至大先导开启压力的所述背压阀形成。该双液压缸同步控制系统，在确保同步控制精度的基础上，能够有效控制系统制造成本。在此基础上，本发明还提供一种应用该控制系统的工程机械。