本发明涉及一种防治牙鲆鱼、刺参盾纤毛虫疾病的中药制剂，是由下列中药原料按重量百分比粉碎而成：青蒿5-20%、苦楝皮5-20%、贯众5-20%、百部5-40%、黄柏5-20%、槟榔5-20%和雷丸5-30％，其组分重量百分比之和为100%。本发明中药制剂依据中药理论选择有抑制或杀灭病原体成分的药物进行组方，加入养殖饵料经寄主摄食后由体液的吸收和供给法彻底杀灭寄生在体内和体表的盾纤毛虫，具有给药操作简单、药效快、杀虫效果好、寄主体质恢复快、成活率高、无毒副作用、无药物残留的优点，大大降低了养殖、育苗生产过程中因盾纤毛虫感染所造成的经济损失。