本发明涉及一种聚酯树脂，具体是涉及一种防腐粉末涂料用聚酯树脂及其制备方法。该聚酯树脂由如下重量百分比的原料经熔融缩聚反应制得：多元醇7.5～33.5%、芳香聚醚二醇5～50%、多元酸29～49%、酸化剂8.5～13.5%、抗氧剂0.1～1.0%、酯化催化剂0.05～0.15%、固化促进剂0～1.0%，酯化催化剂为单丁基氧化锡，芳香聚醚二醇为双酚A附加环氧乙烷或环氧丙烷的化合物。本发明的防腐粉末涂料用聚酯树脂富含芳基醚结构，其具备比酯键有更佳的耐腐蚀性能，采用α和β位烷基取代基的多元醇类以提高酯键抵抗裂解的能力。使通过该聚酯树脂制备的防腐粉末涂料具有卓越的耐腐蚀性能和耐化学品性能，同时还具有优秀的涂膜外观和力学性能，可以替代环氧型粉末涂料应用于防腐领域。