本发明提供一种短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus)，为GY001株，保存编号为：CGMCC No.8639。本发明所筛选的短小芽孢杆菌用于发酵生产胞外多糖。本发明筛选出胞外多糖短小芽孢杆菌其胞外多糖的抵抗酸碱能力强，其独特的活性结构具有对抗对虾病毒的作用独特功能，具有维护良好的对虾消化道平衡的生态作用。可明显提高养殖对虾非特异性免疫水平，大大增强养殖对虾抗病原菌感染力，特别是可以显著提高对虾抵御病毒感染能力等多种生物学功能，成本低廉，易于运输、储藏。