本发明涉及一种自毒物质降解菌。其保藏机构为中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，保藏编号为CGMCC No.6896，保藏日期为2012年11月30日。一种复合微生物肥料由重量比为2～3：7～8的复合微生物菌剂和腐植酸氨组成。本发明通过降解土壤中自毒物质，改善土壤团粒结构，营造有益菌群优势，促进了土壤团粒结构的形成，极大地改善了土壤的微生态系统，增强了土壤透气性，提高了土壤保水保肥能力。本发明使土壤有了可持续增产增收的发展潜力。并且有效转化底肥，释出小分子养份与活性因子，改良土壤肥力，解除化肥、农药及有害因子对土壤的破坏，克服连作障碍。