一种防止复合袋制袋表面擦伤的方法及制袋系统，所述方法包括：（1）在复合膜的非热封型外膜的外表面上覆盖一层非热封型防护薄膜；（2）使所述防护薄膜与所述复合膜同步移动，共同经历制袋机的制袋过程得到复合袋。基于上述方法的制袋系统，包括：沿复合膜行进方向依次设置的复合膜送料机构、第一导向机构、热封机构、牵引辊和出料装置，在所述第一导向机构前设置有防护薄膜送料机构，所述防护薄膜送料机构送出的防护薄膜覆盖在所述复合膜非热封型外膜的外表面上，且所述防护薄膜与所述复合膜同步进入所述第一导向机构。制袋过程中，制袋机的多条导向辊和牵引辊只将所述防护薄膜擦伤，而不擦伤复合膜的表面，避免了复合袋表面存在擦伤的问题。