本发明提供一种1000MW超超临界机组自动控制系统，该系统设有一应力控制单元，通过该应力控制单元可实时检测汽轮机各部件的温度、压力，并根据检测的温度、压力值确定汽轮机各部件的热应力，进而确定高压缸转子、中压缸转子允许的升/降速率，并由汽轮机自动启停控制单元根据计算好的升/降速率自动控制汽轮机的启动/停机。采用该控制系统可以在汽轮机材料应力与最大的运行灵活性上进行最优化控制，使汽轮机可以在最佳工况下启动/停机，汽轮机的转速不会产生较大的波动，机组甩负荷后的快速响应能力强，控制精度高，可保证汽轮机正常平稳运行。大大降低人为的操作失误，减轻用户的工作量，简化了启/停程序。