本发明涉及一种用于培育海水珍珠的马氏珠母贝黑壳品系的选育方法，属于珍珠选育技术领域，该方法以中国马氏珠母贝海南陵水野生群体和北部湾雷州养殖群体等两个地理群体为繁育基础群，在两群体中选优质的个体作为杂交亲本，利用不同地理群体进行正反交和自交培育后代，从中选择生长优势最明显的组合-“雷州♀×陵水♂”后代进行群体闭锁繁育；获得黑壳色特征明显、经济性状优良、遗传性能稳定、拥有一定数量的马氏珠母贝黑壳色品系。本发明选育方法原理可行，工艺步骤简单，生产成本低廉，可显著提高马氏珠母贝的成活率、生长速度、珍珠质量和产量，促进我国海水珍珠养殖业的可持续发展。