本发明属于不锈钢材料领域，具体涉及一种马氏体抗菌不锈钢及其热处理方法和应用。马氏体抗菌不锈钢的化学成分为（重量百分比），C：0.20-0.25%；Si：<1.0%；Mn：<1.0%；P：<0.035%；S：<0.030%；Cr：12-14%；Cu：3.5-4.0%；Mo：1.0-1.5%；Ni：1.5-2.5%；（V+Ti）：0.1-0.3%；N：0.01-0.05%；B：0.001-0.008%；余量为Fe。其热处理方法如下：1000-1100℃固溶处理0.5-1h，油冷至室温；在500-800℃保温2-6h，空冷至室温；980-1020℃固溶处理3-10min，油冷至室温；150-250℃保温1-2h，空冷至室温。本发明的马氏体抗菌不锈钢可广泛应用于卫生器具、食品器具、餐具、刃具以及医疗器械等领域，具有独特的广谱抗菌性能以及更优异的耐蚀性能。