本发明建立了牙鲆抗迟钝爱德华氏菌病优良品系选育方法，主要包括如下的步骤：迟钝爱德华氏菌感染牙鲆鱼苗及其抗病力测定方法、抗迟钝爱德华氏菌病群体筛选方法、抗迟钝爱德华氏菌病家系筛选方法以及抗迟钝爱德华氏菌病家系特异微卫星标记筛选方法等，筛选到抗病家系特异微卫星标记；建立了抗病家系后代抗病力和养殖成活率测试方法，创制了牙鲆抗迟钝爱德华氏菌病优良品系。采用本发明技术生产的牙鲆苗种具有抗迟钝爱德华氏菌病能力强、养殖成活率高、死亡率低、生长速度较快的特点，基本解决了牙鲆苗种夏季因感染迟钝爱德华氏菌而爆发腹水病引起大量死亡的问题，适合在全国沿海地区牙鲆养殖场推广应用。