本发明提供了3D打印用聚碳酸酯复合材料及其制备方法。该聚碳酸酯复合材料的制备方法为将N-氨乙基-γ-氨丙基三乙氧基硅烷与丙烯酸乙酯混合，加入甲基丙烯酸乙酯，再依次加入环糊精、二茂铁甲酸，然后加入聚碳酸酯颗粒，加热搅拌，冷却即可。其中聚碳酸酯的含量为40~50%，N-氨乙基-γ-氨丙基三乙氧基硅烷含量为5~20%，丙烯酸乙酯含量为5~20%，甲基丙烯酸乙酯含量为10~30%，环糊精含量为0.5~2%，二茂铁甲酸含量为0.5~2%。本发明制备工艺简单，制备的聚碳酸酯复合材料可在50~70℃的温度范围内进行3D打印，不会堵塞3D打印机喷头，可用于汽车制造、医疗器械、航空、航天、电子电器等领域。