本发明公开了一种利用3基因聚合效应选育山羊产羔性状的方法，以山羊基因组DNA为模板，利用3对引物分别扩增干细胞因子（SCF）基因的3'非翻译区，III型跨膜酪氨酸激酶受体（KIT）基因的外显子7以及亲吻素（KISS1）基因的内含子1，以浓度为1.5%的琼脂糖凝胶电泳对各扩增产物进行大小判定，采用DNA测序技术筛查3对引物扩增产物的位点突变，然后利用浓度为10%的聚丙烯酰胺凝胶电泳和浓度为3.5%的琼脂糖凝胶电泳对SCF、KIT和KISS1基因的3个位点的SNPs进行基因分型和基因频率分析，分析不同基因型组合与产羔数之间的关系，筛选最佳基因型组合。