本发明公开了一种软骨组织工程支架及其制备方法，属于软骨修复领域。该软骨组织工程支架包括壳聚糖水凝胶外骨架，包覆在壳聚糖水凝胶外骨架中的至少一个表面修饰有骨髓间充质干细胞亲和肽的脱钙皮质骨基质微球。其中，脱钙皮质骨基质微球的球径为500-800μm。本发明实施例提供的软骨组织工程支架，具有良好的流变性、易塑性、生物力学强度、以及特异性地富集骨髓间充质干细胞的性能，从而能够适用于形状各异的软骨缺损区，且效果持久，并能获得更多的分化软骨细胞，具有较强的软骨组织修复能力，便于规模化推广应用。