本发明是一种制备高表达鼠HDAC6且具有高抗病毒感染能力的转基因鼠的方法。该方法是将序列表中序列1导入哺乳动物胚胎干细胞(ES细胞)中，获得高表达鼠HDAC6蛋白的转基因细胞；以所述转基因细胞利用4-8细胞阶段胚胎注射的方法获得转基因胚胎；将所述的转基因胚胎通过手术法移入小鼠子宫内进行妊娠，获得具有生殖系转移的嵌合体转基因后代，通过后代交配产生纯合的转基因小鼠。本发明的方法能在转基因鼠体内稳定表达鼠HDAC6并显著提高鼠的抗病毒感染能力和降低病毒感染死亡率。