本发明公开了一种检测小鼠内耳祖细胞的标记分子，所述的标记分子为Npr3、Ucma和Ogn；本发明提供的细胞标记分子在小鼠内耳祖细胞中是特异性表达的，来自小鼠耳蜗基底膜，通过Phalanx小鼠基因表达谱的检测，表明Npr3、Ucma和Ogn三种基因具有显著的高水平表达，所述细胞标记分子可应用于小鼠内耳祖细胞的鉴定及小鼠内耳祖细胞的分选和纯化依据，可应用于内耳干细胞诱导产生的内耳祖细胞分选以及纯化研究。