本发明公开了一种乳腺癌分子探针，由信号组件和亲和组件构成，其特征在于其亲和组件是对乳腺癌干细胞靶点特异性结合的组件；信号组件是由近红外荧光信号单元和磁共振信号单元组成。其制备方法为：采用化学共价偶联方法将信号功能单元与乳腺癌干细胞的特异性表面标志物单克隆抗体偶联，再经过纯化。本发明是对乳腺癌干细胞多靶点特异结合的分子探针，通过该分子探针能够解决对乳腺癌干细胞的在体检测和定量分析，为实体肿瘤干细胞成像诊断和靶向治疗疗效评估新策略提供依据，为肿瘤早期诊断和分级提供“新模式”，为肿瘤治疗提供精确信息和评估方法，并为进一步解决复发、转移问题垫定诊断信息基础。