本发明公开的内容提供检测癌干细胞的存在的方法和它们在癌症预后，评估癌症转移的风险，鉴定或证实药物候选物，和确定治疗效力中的用途。还提供用于检测癌干细胞的存在的试剂盒以及使用CAIX抑制剂治疗癌症的方法。