本发明提供针对化合物的发育毒性测试的快速的、可再现的、基于生物标记物的筛选方法。这些方法被设计为以预测发育毒性的方式鉴定如下暴露水平，在此暴露水平下一种测试化合物扰乱代谢。具体而言，测量了两种代谢物即鸟氨酸和胱氨酸的扰动，其中鸟氨酸的倍数改变与胱氨酸的倍数改变少于或等于约0.88的比率指示了一种测试化合物的致畸性。