本发明公开了人骨髓间充质干细胞在制备治疗强直性脊柱炎药物中的应用。本发明针对AS患者MSC免疫调节能力下降，不能抑制Th17和上调Treg，使Th17/Treg比例失平衡导致全身处于炎性状态，同时AS患者MSC成骨能力增强，造成AS患者病理性成骨，而这都是造成强直性脊柱炎的潜在病因。本发明通过对AS患者静脉输注健康人骨髓间充质干细胞BMSCs，调节紊乱的免疫功能，并通过抑制MSC的病理性成骨，减缓或改变疾病进程。患者效果十分明显，病人病情改善情况令人满意，可帮助患者减少甚至停用NSAID等药物，并且安全有效、无任何不良副作用。人骨髓间充质干细胞BMSCs来源广，治疗费用较为合理。因此将人骨髓间充质干细胞BMSCs应用在制备治疗强直性脊柱炎药物中具有巨大的社会和经济效益。