本发明属于生物医药领域，具体公开了一种具有卵巢早衰及围绝经期综合征治疗作用的间充质干细胞及其细胞因子制剂及其制备方法。该制剂由脐带或胎盘间充质干细胞及其细胞因子和用于承载所述脐带或胎盘间充质干细胞及其细胞因子并具有缓释和抗炎作用的透明质酸盐组成，经靶向注射到子宫内膜卵巢局部缓释吸收，可达到修复卵巢子宫内膜的疗效，促进功能性排卵，治疗卵巢早衰，缓解围绝经期的各种症状。与现有的静脉回输及介入路径相比，该制剂及其使用方法避免了静脉输注的不良反应，避免了介入治疗所带来的腹部及局部创伤，可有效防止病人因治疗所带来的副作用和损伤，因此，该制剂更安全有效，实用性强，易于推广，具有巨大的应用价值。