本发明涉及一种通过小分子化合物处理来制备多潜能干细胞的方法、试剂盒和用途。在发明中，使分化的细胞与TGF-beta受体抑制剂，GSK3-beta抑制剂和cAMP激活剂接触，由此所述分化的细胞发生细胞命运重编程，产生诱导多潜能干细胞。有利地，所述接触步骤后获得的细胞产物还可以与SAH水解酶抑制剂接触，所述cAMP激活剂可替换为HDAC抑制剂和/或组蛋白去甲基化酶抑制剂，所述分化的细胞还与至少一种选自HDAC抑制剂、RA受体激活剂和组蛋白去甲基化酶抑制剂的化合物接触。本发明能够不使用外源转录因子产生诱导多潜能干细胞（小分子诱导的多潜能干细胞），其具备多向分化的潜能和胚胎干细胞类似的基本特征，可用于疾病模型、药物研发和再生医疗相关研究和应用。