本发明公开了一种人源干细胞与灵芝孢子生物活性物质组合物及其制备方法。首先提取、扩增健康人源干细胞和萌动激活灵芝孢子，再利用超低温、纳米等现代生物技术制备生物活性物质。最后按照一定比例配伍两类生物活性物质形成组合物，利用该组合物可开发成具有细胞生物学活性功能的产品，作用于人体后可活化机体干细胞，修复或替代受损、病变和衰老的细胞，调节机体细胞代谢功能，增强机体免疫力，抗衰老等功效。