本发明公开了一种重组间充质干细胞在制备免疫抑制剂中的应用。具体涉及一种细胞膜上表达趋化因子受体CCR7的重组间充质干细胞，该重组间充质干细胞输注后可体内靶向迁移进至次级淋巴器官，并在二级淋巴器官中的T细胞富集区大量聚集，可以高效地抑制T细胞的免疫反应，在治疗骨髓移植后的移植物抗宿主病、器官移植后的免疫排斥反应以及自身免疫性疾病中可减少成本、减少细胞用量、减轻副作用。更特别的是，治疗中保留了机体杀伤肿瘤细胞的效应，为临床上治疗肿瘤高危人群的骨髓移植后的移植物抗宿主病、器官移植后的免疫排斥反应以及自身免疫性疾病提供了高效且有益的新策略。