本发明属于生物医学领域，尤其涉及一种含有外周血干细胞的生物制剂及其制备方法和应用。发明提供的生物制剂包括外周血干细胞、碱性成纤维细胞因子、基质细胞衍生因子和溶剂。本发明提供的生物制剂含有外周血干细胞、碱性成纤维细胞因子和基质细胞衍生因子，通过三者的协同作用，能够改善心肌功能，激发心脏残存细胞的生存潜能，逆转坏死心肌细胞，修复心脏，从而实现对心肌梗塞的有效治疗。实验结果表明，采用本发明提供的生物制剂注射治疗心肌梗塞的大鼠时，显示出良好的治理效果。