本发明提供了一种治疗再生障碍性贫血的干细胞制剂的制备方法，弥补现有技术的不足，降低移植抗宿主病的发生率，在较短时间内获得更多的具有较强免疫抑制功能的间充质干细胞，满足临床需求，为干细胞的移植功效提供了新的思路，发挥重要的实际应用价值。本发明还提供了一种用于治疗再生障碍性贫血的干细胞制备方法，该方法用特殊方法诱导和培养间充质干细胞，可以有效地提高和增强间充质干细胞免疫抑制能力，可进一步制备成治疗再生障碍性贫血的干细胞制剂。