本发明公开了一种基于微流控的全自动干细胞培养扩增装置，该装置包括微通道培养板以及用于控制微通道培养板的自动控制器。本发明通过自动控制器进而自动控制微通道培养板实现全自动的干细胞培养和扩增，这样不仅大大提高干细胞培养和扩增的效率，提高干细胞的存活率，而且大大减少人工培养所带来的不必要污染，还有由于利用先进的微流控技术，因此本发明能大大提高控制细胞培养液流动的灵敏度和精确度，并且本发明的装置体积小、结构简单、易于操控、功率损耗低以及稳定性高。本发明作为一种基于微流控的全自动干细胞培养扩增装置广泛应用在细胞培养扩增领域中。