本发明提供冷冻保存来源于多能干细胞的组织的方法，所述方法包括以下(1)至(3)：(1)使来源于多能干细胞的组织与含有亚砜和链状多元醇的细胞保护溶液接触，(2)将在所述第一步中与所述细胞保护溶液接触的所述来源于多能干细胞的组织保持在冷冻保存溶液中，以及，(3)在冷却剂存在下，冷冻保存在所述第二步中被保持在所述冷冻保存溶液中的所述来源于多能干细胞的组织。根据本发明的方法，可以提供稳定的来源于多能干细胞的组织的保存方法。