本发明涉及一种神经干细胞来源胞外体（Exosomes）的制备、纯化及鉴定的方法及该胞外体在制备治疗神经系统疾病药物中的应用。该胞外体来源的神经干细胞属悬浮型干细胞，包括鼠神经干细胞以及从间充质干细胞诱导的神经干细胞。其中制备步骤为：无菌条件下，收集3-10代各类型干细胞的完全培养基上清液进行离心，20000g*20min，收集上清液，经0.22μm无菌滤膜过滤除杂，将得到的液体再次离心，120000g*60min，弃上清，取沉淀，得到Exosomes，并运用免疫磁珠法进行纯化处理。Exosomes作为干细胞分泌的一种具有完整胞膜且携带胞质及胞膜中各类活性蛋白及信号分子的囊状小体，可部分或全部发挥神经干细胞的作用，可用于神经系统疾病的治疗。本发明为替代神经干细胞治疗神经系统疾病提供了新的治疗手段与技术支持。